De hace tiempo que uso nepomuk en mi entorno de trabajo basado en KDE4. Yo lo uso etiquetando (poniendo tags) a los ficheros que quiero poder recuperar luego rápidamente. Luego en el gestor de ficheros Dolphin (o también en krunner) con solo buscar con la etiqueta recupero todos los ficheros con ese tag.
El coñazo es etiquetar uno a uno los ficheros con Dolphin (entornos gráficos…) así que me he hecho una aplicación en Python para etiquetar desde la línea de comandos (Link a GitHub). Como verás, mis conocimientos de python son más bien escasos, así que cualquier comentario será bienvenido.
Por cierto, parece que la próxima versión de KDE (la KDE 4.13) cambiarán el motor de búsqueda semántica por defecto, ya veremos qué pasará.